《上海醫藥》以鄧小平理論和“三個代表”重要思想為指導，緊密結合上海醫藥實際，研究上海醫藥資源理論，探索上海醫藥資源開發、配置和利用的客觀規律，總結交流醫藥資源管理實踐經驗，報道專題研究成果，繁榮學術、溝通信息、指導工作，為藥業發展服務，為保障人民健康、全面實現小康社會服務。立足上海，服務全國，面向世界，通過工、商、醫多層次的溝通，為您提供產、銷、用全方位的信息。本刊訂閱對象，主要為醫藥和醫療衛生方面的專業人員，其中包括臨床醫生、藥師；藥品生產、經銷企業的經營、管理、科研人員；醫藥科研院所、情報機構工作人員；醫藥大、中專院校師生以及相關單位的圖書資料室等。

《上海醫藥》是國內外公開發行的，以“醫藥”為核心的綜合性科技期刊，是中國期刊數據庫全文收錄期刊，中國學術期刊綜合評價數據庫統計源期刊，并入選美國《化學文摘》，《中國科技期刊數據庫—全文版》。 《上海醫藥》創刊30多年來，始終堅持“溝通產，銷，用信息，密切工，商，醫聯系”之辦刊宗旨，雜志的品牌和影響已廣泛延伸至“醫”，“工”，“商”等領域，為醫療機構，制藥企業，零售藥房的醫藥專業人員和政府醫藥管理部門的管理者提供大量具有實用價值的合理用藥知識和醫藥科技信息，逐漸成為醫師，藥師和藥學工程事業務交流，提高和繼續教育的平臺，以其獨特的專業性和綜合性特點推進“醫”，“藥”融合，促進上海醫藥衛生事業的發展。 2012年，在堅持基本辦刊宗旨不變的前提下，將充分利用三級醫藥在醫療，科研和教學方面的優質資源，縮短刊物的出版周期，提高刊法論文的時效性，向各級醫療機構的醫藥工作者提供更豐富，前沿的醫藥衛生知識，促進醫藥工作者業務水平的提高。雜志將月刊調整為半月刊。上半月刊主要面向二級三級醫藥，加大指導臨床合理用藥的力度：下半月刊則更加關注社區衛生服務中心。

《上海醫藥》榮獲第三屆華東地區優秀期刊、多次被評為華東地區優秀科技期刊。