《南京審計學院學報》堅持為社會主義服務的方向，堅持以馬克思列寧主義、毛澤東思想和鄧小平理論為指導，貫徹“百花齊放、百家爭鳴”和“古為今用、洋為中用”的方針，堅持實事求是、理論與實際相結合的嚴謹學風，傳播先進的科學文化知識，弘揚民族優秀科學文化，促進國際科學文化交流，探索高等教育、教學及管理諸方面的規律，活躍教學與科研的學術風氣，為教學與科研服務。

《南京審計學院學報》堅持正確的輿論導向，反映國內外經濟、管理、法學等學科和高等教育研究的前沿動態，為我國的改革開放和教育事業的繁榮服務。選用稿件突出理論與實踐的結合的原則。