《南京農業大學學報》（雙月刊）創刊于1956年，是南京農業大學主辦的綜合性農業科學學術期刊，為自然科學版。主要刊登作物遺傳育種、生理生態、栽培與耕作，植物病蟲草害防治，生命科學，園藝科學，食品科學，動物醫學，動物科學，資源與環境科學，農業應用化學及農業工程等學科的研究論文、實驗技術、文獻綜述、科研簡報以及反映最新成果的科技快訊。
《南京農業大學學報》獲中國自然科學核心期刊、全國優秀科技期刊、第二屆江蘇省十佳科技期刊、中國期刊方陣“雙效”期刊。
《南京農業大學學報(社科版)》（雙月刊）創刊于2001年，是南京農業大學主辦、教育部主管的綜合性學術理論刊物，在體現學校學科特色的同時，兼顧其他人文學科。
《南京農業大學學報(社科版)》是堅持以馬列主義、毛澤東思想和鄧小平理論、“三個在代表”的重要思想為指導，傳播社會主義先進文化，關注哲學、社會科學的研究成果，特別是我國改革開放和現代化建設事業中帶有全局性、戰略性、前瞻性的重大問題的研究成果。舉凡有關當代國內國際政治、經濟、文化、科技、道德、哲學、宗教等的研究論文均在本刊選用之列。獲獎情況：2004-2005年，“農村.農民.農業研究”欄目榮獲期刊組優秀欄目二等獎；2010年，“全國百強期刊”；被評為“農村.農業.農民”欄目特色欄目；中文核心期刊(2011)。
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（5）參考文獻應選用公開發表的資料，每篇引用10～25篇文獻，盡可能引用近10年的文獻，其中近5年文獻不少于1/2，英文文獻不少于1/3。并按引用的順序在正文中連續編碼。
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期刊：［序號］責任者.篇名[J].期刊名，年份，卷（期）：起止頁
專著：［序號］責任者.書名[M].版次（第1版省略）.
出版地：出版單位，出版年：起止頁論文集：［序號］析出文獻責任者.篇名[C]//編者.
論文集名.出版地：出版者,出版年：起止頁學位論文：［序號］作者.篇名[D].
保存地點：保存單位,年份 專利文獻：專利申請者.專利題名：專利國別，專利號[P].
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