《日本學刊》（雙月刊）創刊于1985年，是由中國社會科學院日本研究所主辦的綜合性和學術性期刊。1990年2月中華日本學會成立時決定改為學會會刊，并與中國社會科學院日本研究所聯合主辦，更名為《日本學刊》，于1991年1月出版發行。

《日本學刊》是以學術性為主，兼顧知識性，改為《日本學刊》后，進一步突出了其綜合性和學術性，并強調它要為發展有中國特色的日本研究和建立中國的日本學發揮作用。《日本學刊》系全國中文核心期刊，2005年榮獲中國社會科學院優秀期刊提名獎。主要刊登我國日本研究者關于日本諸學科的優秀研究成果，包括日本政治、經濟、外交、軍事、科技、社會文化、語言文學、歷史、哲學等。